忍者商店是获取强力忍者的重要途径之一，合理利用商店资源对提升战力至关重要。夺宝商店解锁需要角色等级达到10级每日可领取一次免费抽奖机会。PVP玩家推荐优先兑换晓大蛇丸碎片，其蛇系技能组合在决斗场压制力极强；PVE玩家则适合选择究忍具如传说品质的草薙剑，能显著增强普攻流忍者强度。参与许愿宝库等联动活动时，建议保留高招券以增加抽奖次数，提高获取S忍碎片概率。每日完成小队突袭和秘境挑战可积攒金币用于十连抽，获得积分后优先兑换忍战我爱罗等易上手的A忍。
积分赛商店中，蝎和飞段是性价比较高的选择。完成蝎的招募后可转向飞段碎片收集，之后将蝎升到五星。生存商店在迈特凯未达五星前应优先兑换其碎片，五星后转为兑换轮回石。组织商店推荐优先消耗铜币，随后兑换轮回石，阿诗玛碎片可通过精英副本获取无需刻意兑换。徽章兑换中金币仅限兑换自来也，银币则建议选择纲手，鬼鲛皮肤可根据个人喜好决定。
特权商店需V1以上且拥有超影资格时再考虑购买，平均每个忍者消耗约4.5万金币。忍者碎片兑换需结合个人金币储备与高招券数量，避免过度消耗资源。特权积分购买碎片次数有限，建议提前规划招募目标。竞猜商店可兑换赛事定制头像框等限定物品，每日限兑3次。玉石商店解锁后，百战水门等忍者碎片可作为长期培养目标，但需注意资源分配节奏。
蝎的秘密商店提供专属忍具和忍者碎片，需达到特定条件解锁。风遁忍者烈斗需通过组织商店用金色徽章兑换，其特殊机制神风可扣除奥义点释放，风之力满时技能形态变化。B级忍者中宇智波佐助的千鸟流和狮子连弹适合PVE与PVP双场景，春野樱的医疗忍术在团队副本作用显著，李洛克的体术在持续输出方面表现突出。需注意不同商店的刷新机制，部分商品需消耗宝石刷新但内容固定。
最终决策需综合玩法倾向与资源储备。PVP向玩家应侧重决斗场强势忍者，PVE玩家则需关注副本特攻型忍具。生存挑战推荐搭配控制与爆发型阵容，实时PK需考虑忍者技能衔接与替身时机。通灵兽与密卷的选择应与主力忍者形成互补，组织战阵容需兼顾属性克制与先手优势。商店资源分配需预留部分应对突发活动，避免因集中兑换导致关键资源短缺。
